猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1的分子大尺度协同运动与 催化功能关系研究

›› 2019, Vol. 4 ›› Issue (6): 72-76.

猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1的分子大尺度协同运动与催化功能关系研究

（1.云南省大理白族自治州血吸虫病防治研究所，云南大理 671000；2.武汉大学基础医学院，武汉 430071；3.大理大学农学与生物科学学院，云南大理 671003）

收稿日期:2019-02-25 出版日期:2019-06-15 发布日期:2019-06-15
通讯作者: 杨力权，副教授，博士，E-mail：ylqchem@sina.com.
作者简介:杨琳，主治医师，主要从事寄生虫诊治研究.

StudyontheLarge-ScaleMolecularConcertedMotionsandFunctionofCysteineProtease TsCL-1fromCysticercusCellulose

（1.DaliInstituteofSchistosomiasisPreventionandControl,Dali,Yunnan671000,China;2.SchoolofBasicMedicalSciences, WuhanUniversity,Wuhan430071,China;3.CollegeofAgricultureandBiologicalScience,DaliUniversity, Dali,Yunnan671003,China）

Received:2019-02-25 Online:2019-06-15 Published:2019-06-15

摘要/Abstract

摘要： 目的：通过分析猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1的分子大尺度协同运动对功能发挥的影响，阐述TsCL-1分子动力学行为与其催化性能的关系。方法：通过对TsCL-1分子动力学模拟的平衡轨迹进行本质动力学分析，对TsCL-1的大尺度协同运动进行研究，探讨其运动模式与生物学功能的关系。结果：TsCL-1的大尺度协同运动模式主要表现为大量表面环区和底物结合部位环区的运动，这些运动会导致底物结合口袋在尺寸和形状上的变化，因此可能和底物的结合、定位、催化以及产物释放有关。结论：TsCL-1的大尺度协同运动模式，与底物的结合、定位和催化反应相关，将有利于其催化功能的发挥。

关键词: 猪囊尾蚴, 半胱氨酸蛋白酶TsCL-1, 本质动力学分析, 大尺度协同运动, 结构-动力学-功能关系

Abstract: Objective: The relationship between the molecular dynamics behaviors of TsCL-1 and its catalytic properties was elucidatedbyanalyzingtheeffectsofthelarge-scalemolecularconcertedmotionsandfunctionofcysteineproteaseTsCL-1secreted fromCysticercuscellulose.Methods:TheEssentialDynamicAnalysiswasperformedtorevealthelargeconcertedmotionsofTsCL-1, andtofindouttherelationshipbetweenthemolecularmovementandthecatalyticfunctionoftheenzyme. Results:Themajormotion modesofTsCL-1wereconcerteddisplacementsofsubstrate-bindingregionsandofregionsnearthesubstrate-bindingsites,which resultedinchangesinshapeandsizeofsubstratepocketsand,asthus,wererelatedtosubstratebinding,orientation,catalysis,and productrelease. Conclusion: ThemajormotionmodesofTsCL-1arenotonlyrelatedtosubstratebinding,location,andcatalytic reactionofTsCL-1,butarealsobeneficialtothecatalyticfunction.

Key words: Cysticercosiscellulose, CysteineProteaseTsCL-1, essentialdynamicanalysis, large-scaleconcertedmotions, structuredynamics-functionrelationship

中图分类号:

S852.7

杨琳，朱月勋，赵琴平，杨力权. 猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1的分子大尺度协同运动与催化功能关系研究[J]. , 2019, 4(6): 72-76.

YangLin,ZhuYuexun,ZhaoQinping,YangLiquan. StudyontheLarge-ScaleMolecularConcertedMotionsandFunctionofCysteineProtease TsCL-1fromCysticercusCellulose [J]. , 2019, 4(6): 72-76.

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